277Ma前の二畳紀前期、石林地域の海底には厚い灰岩層が堆積されている。その後、地殻変動によって、担林地域は次第に上昇し陸地になった。石灰岩は圧迫を受け、二つの割れ目ができた。

257Ma前の二畳紀前期の末、石林地区は低海抜環境で、石灰岩の中で最も初期の石林の地形が発達した。

250Ma前の二畳紀後期の初期、火山作用によって形成された玄武岩は石林地域を覆い、その状態は中世まで続いていた。

56Ma前の新生代の初期、玄武岩の大部は浸食され、初期石林の一部が再び地上に露出した。

56~23Ma前の古第三紀始新世－漸新世、傾動の上昇により石林地域の西側は古代湖になった。石林の一部は再び湖の堆積物に覆われた。同時に、湖の周辺には新しい石林が発達した。

23Ma前の新第三紀中新世以来、古代湖が消え、石林地域は次第に高原盆地に変化した。同時に、最新の石林が発育した。